Wir schreiben das Jahr 2212. Die natürlichen Ressourcen der Erde sind nahezu aufgebraucht. Der Ginkgo Biloba, der älteste und stärkste Baum der Welt, ist zum Symbol einer neuen und naturnahen Art der Bebauung geworden.

In Ginkgopolis schlüpfen die Spieler in die Rolle von modernen Stadtplanern, welche die Gebäude der Stadt bauen und betreiben, um so viele Erfolgspunkte wie möglich zu sammeln.